肛瘘是指肛门附近及直肠下部发生的血管，管的一端开口于肛管或直肠(即内口)，一端开口于皮肤(即外口)。肛瘘也是一种常见病，约占肛门直肠疾病的四分之一。多数是肛门直肠周围脓肿、溃破或切开后遗留下来的后遗症。
肛瘘是怎样发生的呢?因为肛瘘是肛门直肠周围成感染和脓肿的后遗症，而肛蜜炎又是肛门直肠周围感染的主要起源，所以要想知道肛瘘是怎样发生的，必须从肛瘘谈起。肛窦位于两个肛柱和一个肛瓣之间，很像一个开口向上的口袋。
肛窦底部有肛腺的导管开口，正常的肛窦中有肛腺分泌的粘液，它有润滑大便的作用。如果肛窦中积存了粪渣，过多的粘液，因引流不畅，只要有轻微的外伤（如肛管上皮和直肠粘膜被干粪块擦伤)，细菌就会趁机而入，生长繁殖，从而引起肛窦急性炎症和肛窦底部腺体的感染，即所谓肛窦炎。如肛窦炎未能得到及时治疗，炎症可以扩散到肛门直肠周围的疏松组织间隙中去，并迅速蔓延，引起肛门直肠周围感染，形成脓肿。脓肿自行溃破或切开引流以后，脓腔虽逐渐缩小，但因脓腔一般是和引起脓肿的肛窦相通的。所以，常会有肠道内容物进入脓腔，这些内容物中含有大量细菌和粪便，并经常刺激脓腔内的肉芽组织，使其增生和纤维化。
同时，在脓腔逐渐缩小过程中，往往形成弯弯曲曲的管状腔道，使腔道中的脓液、分泌物和由洞口进入的肠道内容物不易排出，所以管道也不易完全愈合。天长日久，腔道及外口周围被大量瘢痕组织包围，更延迟了愈合，最后形成慢性管道，即称为肛瘘；如果外口暂时愈合，由内口进入的细菌又引起急性炎症，还会形成新的脓肿，脓肿溃破后又可以产生新的瘘口，所以一个肛瘦可以同时有几个外口。
我国医学认为肛瘘是由“湿热流注肛旁，郁久化热，穿肠串臀，则成痛肿，溃后疮口不敏”引起的。肛瘘的治疗方法很多，目前一般采用挂线疗法。
