百日咳是由百日咳杆菌引起、好发于儿童的急性呼吸道传染病。这种病的病程长达2～4个月（大约100天)，所以称为百日咳。这种病的传染性很强，所以祖国医学又称“疫咳”。这种病的主要特征为阵发性痉挛性咳嗽，咳后喉中有一种特殊的吸气性吼声，如水鸡样的鸣响，所以又称“鸡咳”。祖国医学还把它称为“鹭鹚咳”、“顿咳”、“天哮哈”等。
百日咳杆菌离开人体后容易死亡，所以不易通过污染日．常生活用品间接传染，主要是通过患儿咳嗽、打喷嚏、谈话时喷出的飞沫直接传染。当人体抵抗力减弱(如受凉感冒之后）的时候，百日咳杆菌就会侵入人体而发病。
细菌侵入呼吸道后，产生内毒素，引起喉头、气管、支气管粘膜发炎。粘膜粘液腺分泌大量粘液，粘液将粘膜表面的纤毛粘着在一起，因而粘液性分泌物不易被排出。大量粘液性分泌物积聚在气管、支气管内，不断刺激粘膜内神经末梢感受器，这种刺激传达到大脑，形成咳嗽中枢的兴奋，而产生强烈的连续性痉挛性咳嗽。这种咳嗽久之则成条件反射，所以有些患儿病原体早已消失，仍继续痉咳面不痊愈。
百日咳如不及时治疗，病程真能拖一百天左右，如治疗及时(早期治疗)，可使病程大大缩短。
祖国医学认为百日咳发病主要原因是外感时邪疫毒之气，从口鼻犯肺，肺气不宣，上逆而为咳嗽，继则痰热壅肺，气火上逆，而致痉咳加剧。
百日咳整个病程可分三个阶段：
1、炎症期(此期约历时7～10天，此期的传染性最强)：
此期的症状与一般的伤风咳嗽无大差别，若无明显的百日咳接触史，不易想到此病。最早的症状就是咳嗽，偶见打喷嚏和轻微发热。一般感冒症状与低热三天内即见消退，但咳嗽却逐渐加重，并逐渐出现阵发性痉挛性咳嗽。
炎症期的治疗法则是宣肺祛邪。
处方：杏仁10克，麻黄10克，橘红6克，百部10克，桑白皮10克，黄芩6克，甘草6克，水煎服。
2、痉咳期（此期约历时2～6周)_：咳嗽逐渐加重，发作即出现成串的紧接不断的咳嗽，连续到十几声以至数十声后，发出一种特殊的高音调的、很象火鸡叫或鸟啼的声音。一连串紧促的咳嗽跟着来一下长出气，如此反复循环。
而且一次比一次加剧，直到呼吸道积聚的痰深一冲而出为止。胃内容物经常同时吐出。经过一次发作，常能安静一段时间，隔几分钟以至数小时再次发作。发作前一般无明显预兆。一些外因，如进食、周围空气骤变、尘土的吸入、烟熏、过分疲劳、情绪激动等都有引起发作的可能。
痉咳期的治疗法则是清肺，止咳，化痰。
处方，黄精、百部各10克，天冬、麦冬、射干、百合、紫菀、积实各6克，甘草3克，水煎服。
3、恢复期，咳嗽逐渐减轻，次数减少，吼声消失，但咳而无力，气短声弱，或易出汗、口渴、潮热，舌质红（此期约历时2～3周)。
恢复期的治疗法则：滋阴养肺。
处方，沙参10克，麦冬10克，花粉10克，紫菀10克，五味子10克，水煎服。
